@MASTERSTHESIS{ 2023:1469365329,
 	title = {Aplicação de métodos de dinâmica molecular e QM/MM no estudo reacional da enzima lisina metiltransferase G9a},
 	year = {2023},
 	url = "https://tedebc.ufma.br/jspui/handle/tede/tede/4717",
 	abstract = "A epigenética é a área de conhecimento responsável por examinar o comportamento dos 
 genes e como eles reagem diante de inúmeros fatores que estão presentes ao logo da vida 
 do indivíduo. Uma das maneiras de realizar esse tipo de estudo é por meio do método de 
 dinâmica molecular (DM) o qual é muito utilizado em sistemas com características 
 biológicas permitindo que os sistemas replicados computacionalmente se assemelhem a 
 situação biológica real. Neste trabalho foi investigado os mecanismos de reação e 
 atividade da enzima lisina metiltransferase (MT) G9a por meio de simulações de 
 dinâmica molecular. Foram analisadas mutações que a histona 3 lisina 9 (H3K9) pode 
 sofrer por conta dos mecanismos epigenéticos, e calculados os valores de energia livre 
 referente a cada uma dessas mutações, também foi verificada a distância média da H3K9 
 e suas mutações em complexo com a MT G9a e o comportamento reacional dos sistemas
 mutantes. Para o desenvolvimento do trabalho foram usadas estruturas obtidas do Protein 
 Data Bank para utilização das estruturas utilizadas ao longo da pesquisa onde essas 
 estruturas/sistemas foram tratadas com o campo de força CHARMM32 e simulados no 
 software AMBER. Cinco sistemas foram construídos: H3K9 nativo e mutantes: H3K9M, 
 H3K9A, H3K9I e H3K9Nle. Foram realizadas diferentes analises com o intuito de 
 verificar qual desses mutantes se destacaria quando em complexo com a enzima G9a e 
 consequentemente a inibição do processo de metiltransferase relacionado ao processo de 
 neoplasia. Os resultados dos primeiros 150ns de dinâmica molecular mostram que os 
 mutantes H3K9M e H3K9I apresentaram complexos mais estáveis, cálculos de energia 
 livre usando MM/PBSA e MM/GBSA apontaram novamente as mutações H3K9M e 
 H3K9I como as mais energicamente favoráveis. Esses resultados estão de acordo com as 
 observações experimentais disponíveis na literatura. Sendo assim a lisina 9 com a 
 mutação da metionina e da isoleucina podem atuar como inibidores eficientes da enzima 
 G9a, posteriormente podendo ocasionar problemas como o câncer.",
 	publisher = {Universidade Federal do Maranhão},
 	scholl = {PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM QUÍMICA/CCET},
 	note = {DEPARTAMENTO DE QUÍMICA/CCET}
}