@MASTERSTHESIS{ 2022:2102695798,
 	title = {DIVERSIDADE BACTERIANA EM CARCINOMA PENIANO: UMA ABORDAGEM MICROBIÔMICA},
 	year = {2022},
 	url = "https://tedebc.ufma.br/jspui/handle/tede/tede/4462",
 	abstract = "O Carcinoma de Pênis é raro e representa menos de 0,5% de todos os cânceres em homens 
 do mundo. No Brasil possui taxas de incidência que variam entre 2,9 e 6,8%, afetando 
 principalmente indivíduos com baixo nível socioeconômico e educacional, sobretudo nas 
 regiões Norte e Nordeste. A má higiene na região genital, dificultada pela ausência de 
 circuncisão da glande, proporciona uma proliferação microbiana e resulta no acúmulo de 
 secreções, como o esmegma, que pode causar inflamação crônica do epitélio e contribuir 
 para o estabelecimento do tumor. O avanço das técnicas moleculares aplicadas à
 identificação de microrganismos tem impulsionado o conhecimento sobre a relação da flora 
 microbiológica em alguns cânceres. No entanto, não há relatos sobre o microbioma em 
 tumores de pênis. Dessa forma, este trabalho é pioneiro em identificar, por meio de uma 
 abordagem microbiômica, a diversidade bacteriana em Carcinoma de Células Escamosas do 
 Pênis (CCEP), e sua relação com a etiopatogenia desse tumor. Para isso, amostras de tecido 
 tumoral pareadas com tecidos não-tumorais adjacentes ao tumor primário foram coletadas 
 de 19 pacientes com diagnóstico clínico e histopatológico de CCEP, virgens de tratamento.
 Todos os pacientes (idade de 62.6 ± 16.5 anos) apresentaram infecção por HPV, a maioria 
 de alto risco ongogênico (79%) com baixo nível de escolaridade, 78,9% possuíam tumores 
 localizados em glande e prepúcio e 73% dos tumores eram avançados (pT2 ou pT3), 
 resultando em cirurgias de penectomia total (21%) ou parcial (73%). O sequenciamento de 
 nova geração (SNG) foi realizado a partir de DNA extraído dos tecidos tumorais e não tumorais, e a biblioteca genômica foi preparada seguindo protocolo da Neoprospecta 
 Microbiome Technologies, Brasil. A região V3-V4 do gene 16S rRNA e os amplicons de cada 
 amostra foram indexados e sequenciados utilizando o MiSeq Sequencing System (Illumina
 Inc., EUA). A qualidade das sequências foi avaliada pelo software FastQC v.0.11.8. A análise 
 de bioinformática (DADA2, QIIME2 v.2020.2) foi usada para classificar e avaliar a diversidade 
 do microbioma, tanto no tumor primário, quanto no tecido não-tumoral adjacente. Foi 
 realizado um levantamento bibliográfico buscando dados de microbioma de tecido peniano 
 não-tumoral e de tecidos de tumores associados a HPV, com histopatologia semelhante a 
 CCEP. O PICRUST2 foi utilizado para predizer a composição funcional. Na análise global 
 das amostras foi verificado que os filos Proteobacteria e Firmicutes , assim como os gêneros 
 Alcaligenes e Fusobacterium, foram os mais abundantes em ambos os tecidos, sendo que 
 os filos Fusobacteroidota e Campylobacterota e os gêneros Fusobacterium e 
 Chromobacterium foram estatisticamente significativos quando comparados com suas 
 amostras pareadas. Ressaltamos a ocorrência de bactérias associadas ao processo 
 inflamatório, tanto nos filos quanto nos gêneros mais abundantes, tais como: Fusobacterium 
 nucleatum e Prevotella. Por outro lado,não foi observada abundância relativa significativa de
 Mycobacterium. Apesar de não ter sido observada diferença estatística nas diversidades alfa 
 e beta das amostras pareadas, análise estratificada dos pacientes mostrou que para tumores 
 avançados (pT2 e pT3) houve uma tendência para formação de dois grupos distintos
 caracterizados por gêneros bacterianos diferentes (p=0,08). Identificamos que Prevotella é 
 comum para CCEP, CCECP, CCEC e CV, enquanto os gêneros Alcaligenes, Eubacterium, 
 yurii group e Pseudoglutamicibacter, são específicos para CCEP. A análise funcional revelou 
 35 top vias, dentre as quais seis apresentaram maior poder de predição (p-value e diferença 
 de abundância): degradação de quitina, degradação de myo-inositol, degradação de myo chiro e scyllo-inositol, degradação de hexuronato, biosíntese de sacarose e degradação do 
 oligômero nylon-6. Álém disso foram relatadas ASVs (Amplicon Sequence Variants) únicas e
 abundantes dos gêneros Alcaligenes, Streptobacillus e Bacillus nos tecidos tumorais (p<0,05) 
 enquanto ASVs únicas dos generos Cupriavidus, Staphylococcus e Finegoldia foram mais 
 abundantes nos tecidos não-tumorais adjacentes (p<0,05). Os resultados mostraram uma 
 microbiota de CCEP abundante, mas também com ASVs únicas, além de apresentar táxons 
 bacterianos e vias moleculares relacionadas aos processos inflamatórios, ratificando o papel 
 da inflamação na etiopatogênese do CCEP, abrindo perspectivas de políticas públicas de 
 prevenção, prognóstico e tratamento.",
 	publisher = {Universidade Federal do Maranhão},
 	scholl = {PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIAS DA SAÚDE/CCBS},
 	note = {DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA/CCBS}
}