@PHDTHESIS{ 2021:26142496, title = {Análise genômica de Limosilactobacillus fermentum ATCC 23271, uma linhagem com potencial probiótico e atividade anti-Candida}, year = {2021}, url = "https://tedebc.ufma.br/jspui/handle/tede/tede/3969", abstract = "Vários microrganismos vêm sendo estudados como potenciais probióticos nos últimos anos. Alguns desses estudos mostram benefícios à saúde, inclusive em ensaios clínicos com humanos. Esses benefícios podem estar relacionados à sua habilidade de regular a microbiota intestinal através da competição por sítios de adesão, bem como pela produção de compostos antimicrobianos e/ por apresentarem efeitos imunomodulatórios. O presente estudo teve como objetivo realizar uma análise genômica de Limosilactobacillus fermentum ATCC 23271 em relação ao seu uso como microrganismo probiótico. Para isso, foi realizado o sequenciamento genômico da linhagem, seguido de análise filogenética em comparação com os genomas de outras linhagens de L. fermentum, bem como análises em diferentes bases de dados visando detectar potenciais genes relacionados a tolerância aos sais biliares, enzimas digestivas e pH ácido, genes associados às propriedades de adesão, genes de bacteriocinas e genes relacionados à segurança da linhagem para uso humano. Também foram feitos testes in vitro para confirmar a atividade antimicrobiana e interferência na adesão de patógenos. A análise do genoma revelou que a linhagem ATCC 23271 possui 2.193.335 bp, com 2.123 sequências codificadoras de proteínas e um conteúdo de guanina-citosina de 50,9%. A análise filogenética revelou que a cepa ATCC 23271 compartilha 941 clusters de genes com seis outras cepas probióticas de L. fermentum, mas apenas 13 clusters são exclusivos da ATCC 23271. Foram identificados no seu genoma genes conhecidos por conferir propriedades probióticas, incluindo genes relacionados a adesão, tolerância a pH ácido e sais biliares, tolerância ao estresse oxidativo, metabolismo e transporte de açúcares e outros compostos. O programa BAGEL 4 mostrou a presença de uma proteína hipotética com baixa similaridade (48%) com a enterolisina A. A linhagem demonstrou ser segura para uso humano, visto que seu genoma não revelou genes de resistência adquirida a antibióticos e nem genes relacionados à virulência, não sendo caracterizada como patógeno humano. Além disso, loci gênicos associados com sequencias CRISPR/CRISPR e duas regiões de profago incompletas foram detectadas no genoma, o que limitaria a disseminação de eventuais genes de resistência adquirida. A tolerância aos sais biliares (0,5 e 1.0%) e ao pH ácido (pH 2. e 4.0) foi demonstrada in vitro. Foi observada a capacidade de inibir a adesão de algumas linhagens de Candida às células HeLa, principalmente dos isolados clínicos genitais, nos ensaios de competição e deslocamento. No ensaio de antagonismo foi confirmado que a linhagem tem a capacidade antifúngica, uma vez que inibiu diferentes linhagens de Candida spp., exceto duas de C. krusei, porém não apresentou nenhuma inibição relevante contra as linhagens bacterianas utilizadas. Além disso, todos os antibióticos aos quais L. fermentum ATCC 23271 mostrou resistência ou foi moderadamente suscetível eram sugestivos de resistência intrínseca, mas não de adquirida. Nossos dados revelam as características do genoma de L. fermentum ATCC 23271 que podem demonstrar um quadro promissor para o uso dessa bactéria probiótica por seus benefícios funcionais, principalmente contra infecções por Candida.", publisher = {Universidade Federal do Maranhão}, scholl = {PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM REDE - REDE DE BIODIVERSIDADE E BIOTECNOLOGIA DA AMAZÔNIA LEGAL/CCBS}, note = {DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA/CCBS} }